鉴定翻译后修饰的蛋白质，找出修饰类型和位点，并对修饰蛋白进行功能分析，获得其在信号转导途径中的功能等信息。

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双向电泳(Two-dimensional electrophoresis)的基本原理是利用蛋白质的等电点和分子量不同而分离蛋白质：第一向电泳——等电聚焦（IEF）根据蛋白质的等电点不同将蛋白质分离，第二向电泳——十二烷基硫酸钠—聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS—PAGE）利用蛋白质的分子量大小不同将

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对Mascot和EQUEST等搜索引擎的结果进行质量控制，货期数量更多的高可靠的肽段和蛋白质鉴定结果

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蛋白全谱分析是指蛋白质组分分析，是以完整的组织、血液或体液等复杂样本为研究对象，目的在于识别出样品中尽可能多的肽段和蛋白质。

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